Im zweiten Teil der sechsten Staffel gibt es wieder spektakuläre Morde für das Team von CSI Miami zu lösen. Aber auch private Probleme verlangen die volle Aufmerksamkeit einzelner Teammitglieder.
Leutnant Horatio Caine (David Caruso) kämpft mit seiner Ex-Freundin Julia Winston im zweiten Teil der 6. Staffel, um das Sorgerecht ihres gemeinsamen Sohns Kyle Harmon (Evan Ellingson). Sie stellen den Sohn somit vor die schwierige Entscheidung, bei wem er leben möchte. Auch die Fälle verlangen von dem Team um Horatio Caine einiges ab. Eine verdeckte Informantin eines Drogendealer-Rings wird ermordet in einem Apartment aufgefunden. Es deutet einiges darauf hin, dass das FBI etwas damit zu tun haben könnte... Während Horatio in einem Mordfall in den Everglades ermittelt, wird das Teammitglied Calleigh Duquesne (Emily Procter) von zwei Gaunern entführt, die ihre Telefonnummer auf einer Webseite veröffentlicht fanden. Diese zwingen Calleigh den Schauplatz eines Mordes für sie zu säubern. Aber nicht nur für Calleigh wird es gefährlich. Horatio muss das Team auch beschützen, nachdem die neue Gerichtsmedizinerin an einem Tatort plötzlich erschossen wird. Vieles deutet auf einen Rachefeldzug gegen Horatio hin, der auf dem Flughafen von Miami seinen Höhepunkt finden soll...

Folge 19 - Ihre letzte Leiche (Rock and a Hard Place)
Folge 20 - Heiße Drähte (Down To The Wire)
Folge 21 - Horatio, wo ist dein Sieg? (Going Ballistic)